Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms