Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApofQ91V80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms