Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms