Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Uhrf1Q8VDF2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms