Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms