Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Impg1Q8R1W8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Impg1Q8R1W8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms