Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms