Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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