Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms