Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms