Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp3Q7TNH6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nphp3Q7TNH6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms