Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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NinlQ6ZQ12 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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NinlQ6ZQ12 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NinlQ6ZQ12 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms