Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gga2Q6P5E6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms