Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt77Q6IFZ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt77Q6IFZ6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms