Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms