Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lcn3Q62471 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lcn3Q62471 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lcn3Q62471 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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