Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms