Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms