Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd40Q5SUE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms