Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms