Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf1Q5ND28 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms