Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl5Q5DTT4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms