Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms