Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa20Q45VN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms