Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms