Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnah12Q3V0Q1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms