Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms