Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fchsd2Q3USJ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fchsd2Q3USJ8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms