Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nkx6-3Q3UHX8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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