Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim43aQ3TL54 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim43aQ3TL54 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms