Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam107bQ3TGF2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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