Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RubcnlQ3TD16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RubcnlQ3TD16 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms