Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms