Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp39Q02525 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms