Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms