Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms