Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tuba4aP68368 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tuba4aP68368 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tuba4aP68368 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tuba4aP68368 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tuba4aP68368 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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