Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr2iP60898 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr2iP60898 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms