Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csrnp1P59054 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csrnp1P59054 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csrnp1P59054 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csrnp1P59054 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms