Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms