Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aqp4P55088 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms