Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms