Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms