Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms