Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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