Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms