Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms