Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrafP28028 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BrafP28028 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BrafP28028 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BrafP28028 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BrafP28028 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BrafP28028 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms