Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Xrcc5P27641 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xrcc5P27641 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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