Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo2P25801 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms